Circos官网 http://circos.ca
在线绘图工具 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/
Circos图的诞生
Circos图诞生于2009年，当时是作为一个绘图工具类的文章发表在Genome Research（最新IF：9.944）上，其作者是Martin Krzywinski，可为“Circos之父”，我们姑且尊称他为“马老师”。从那时出现开始便多次出现在国际知名杂志，比如Nature、Science、Cell上。截止到2019年9月该文章已被引用将近3,500次
Circos图的用途
Circos图其实是一个用途非常广泛的图形，可以用于表征基本上任何类型的数据，包括把我们常见的散点图、折线图等都可以整合到Circos图中。特别的，Circos图尤其适合用来描述生物信息学和基因组学的数据。
Circos图的做法
绘制Circos图有以下几种做法，由难到易依次为：
方法一：Perl 语言
官方提供的绘制Circos图的软件叫做Circos，是一个由Perl语言编写的一个非常庞大的软件，安装起来非常麻烦：
1. 下载安装Perl语言
2. 从Circos官方网站下载Circos：http://circos.ca/software/download/
下载好之后就是安装Circos需要的Perl模块，粗略统计了一下，Windows中的Active Perl如果要运行Circos，需要安装十几个模块，所以这个很麻烦，难度也很大。
方法二：R语言
推荐几个可以做Circos图的R包
-- circlize
-- RCircos
方法三：Circos Table Viewer
这个是Circos官方在线的绘图工具，网址如下
http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/
这个网站很慢，可能还需要翻墙
这是目前为止最为简洁的绘制Circos图的方法，只要上传一个文本文件就可以绘图了。具体绘图步骤如下：
1. 进入在线绘图网站
http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/
2. 准备数据
数据需要放到文本文件中，用空格或者制表符分隔
由于Circos Table Viewer不接受小数，将相关系数都乘以1000
3. 上传文件
点击 “浏览” 上传文件，然后点击 “Visualize Table” 即可生成Circos图
4. 下载Circos图